Co-infection par le virus Zika et la dengue chez un voyageur revenant d’Haïti: présentation clinique et analyse génétique

Le virus Zika et le sérotype du virus de la dengue ont été isolés chez un patient ayant voyagé en Haïti et ayant développé fièvre, éruption cutanée, arthralgies et conjonctivite. Le virus Zika infectant était apparenté à des souches vénézuéliennes et brésiliennes mais dérivait de souches isolées dans la même région. d’Haïti

Le virus Zika, le virus de la dengue, le virus ZIKV et le virus de la dengue sont des virus à ARN transmis par les moustiques appartenant à la famille des Flaviviridae Les virus de la dengue sont endémiques en Haïti, [1] un pathogène émergent en Haïti et dans les Amériques, avec une introduction apparente de la Polynésie française et de l’île de Pâques en – Comme récemment rapporté par notre groupe , ZIKV a été isolé chez des enfants dans une clinique scolaire dans la région de Gressier en Haïti. aucune autre documentation sur les cas de Zika avant janvier, lorsque le ministère haïtien de la Santé publique et de la Population a signalé des cas confirmés en laboratoire à l’Organisation panaméricaine de la santé, dans le cadre d’une importante épidémie survenant dans plusieurs régions du pays. / ZIKV chez un voyageur en Haïti, décrivent la présentation clinique, et fournissent une analyse phylogénétique qui met en évidence le rôle potentiel de l’épidémie haïtienne dans le va diversification et propagation de ZIKV dans le monde entier

RAPPORT DE CAS

Après une visite en Haïti où elle travaillait sur un projet de recherche, elle est arrivée à Port-au-Prince en janvier et s’est immédiatement rendue à Gressier. Elle travaillait à Carrefour, une ville voisine Bien qu’elle ait utilisé un insecticide% DEET diéthyltoluamide deux fois par jour, elle a été mordue par des moustiques au milieu de l’après-midi. alors qu’elle travaillait à Carrefour, et le matin à Gressier avant de partir pour Carrefour, et encore une fois le soir à Gressier à son retour à l’enceinte. Elle est retournée aux Etats-Unis après janvier. Elle a tenu un journal de ses symptômes. de son retour, elle a développé son premier symptôme: une éruption cutanée diffuse, non prurigineuse, blanchissante, maculopapulaire sur sa région abdominale. Janvier, jour réponse. Fatigue, fièvre subjective, bouffées de chaleur et malaise Ce jour-là, elle a pris des photos de l’éruption sur son cou et sa cuisse. Figure B et C Son éruption a progressé pour impliquer tout son corps, y compris les paumes et les plantes. Le jour, la patiente s’est présentée à la clinique externe de l’Université de Floride. Elle a nié les fièvres, la toux, les maux de gorge, la congestion nasale, la douleur rétro-orbitaire, les douleurs abdominales ou la diarrhée et était afébrile avec des signes vitaux normaux. notable pour une éruption résolutive, une nouvelle injection conjonctivale bilatérale, et la douleur et le gonflement des articulations des doigts, des chevilles et des genoux, ce qui rendait difficile à supporter Le reste de son examen était normal L’éruption du patient résolue par jour Sa douleur articulaire résolue et elle Elle se sentait de nouveau en bonne santé le jour, bien que ses yeux ne soient pas revenus à la normale avant le jour. Figure Agrandir la photoTélécharger la diapositiveTimeline, manifestations physiques et résultats des tests du patient atteint de dengue double sérotype viral / infection par le virus Zika A, Chronologie du voyage, manifestations physiques et résultats du test B, Éruption érythémateuse fine au niveau du cou et de la poitrine le jour après le début des symptômes C, éruption cutanée sur la cuisse, jour J, décongestion A, Chronologie du voyage, des manifestations physiques et des résultats des tests B, Fine, éruption érythémateuse sur le cou et le haut de la poitrine le jour après la mise en route du symptôme apparition des symptômes C, éruption sur la cuisse, également le jour D, résolution de la conjonctivite le jour après l’apparition des symptômesSamples de sérum et d’urine envoyés au Florida State Laboratory le jour étaient négatifs pour l’ARN génomique viral ZIKV par transcription inverse en chaîne RT-PCR As par protocole, le sérum a également été testé pour le chikungunya et l’ARNv de DENV par RT-PCR et était positif pour le DENV- seulement. Le jour, des échantillons d’urine et de salive ont été Figure D L’ARN génomique viral a été extrait à l’aide d’un mini kit d’ARN viral QIAamp Qiagen Inc, Valencia, Californie, en suivant les instructions du fabricant et analysé par RT-PCR en utilisant des amorces comme Dans les expériences de contrôle, les amorces de ZIKV n’ont pas amplifié les séquences de souches de laboratoire de DENV-through, et les amorces spécifiques de chaque sérotype de DENV n’ont pas amplifié les séquences de DENV-, et ZIKV. amplification des séquences d’une souche laboratoire de ZIKV Génotype africain L’urine et la salive étaient positives pour les ARNv DENV et ZIKV par RT-PCR Des aliquotes des échantillons d’urine et de salive ont été inoculées sur des cellules cultivées pour évaluer l’infectiosité virale. Des effets cytopathologiques précoces ont été observés jours après inoculation et étaient répandus dans la journée dans les cellules de moustiques et de mammifères, y compris LLC-MK Figure supplémentaire culture cellulaire supern Le génome complet du ZIKV a été séquencé par la marche du génome La séquence consensus, basée sur l’ARNv purifié à partir de cellules LLC-MK, a été désignée ZIKV Haïti // numéro d’accès GenBank KX, et était distinct de la souche de contrôle de la lignée africaine MR La souche de dengue subit une autre analyse de séquence, mais était distincte de la souche de contrôle de Nouvelle-Guinée C ATCC-NR-

Pour les analyses phylogénétiques, toutes les séquences de nucléotides ZIKV disponibles ont été alignées pour générer un alignement complet du génome et un alignement du gène NS. En utilisant les séquences du génome complet disponibles, IQ-TREE a été utilisé pour déduire un maximum de vraisemblance. phylogénie , évaluer la fiabilité des branches internes de l’arbre par bootstrap, et calculer des probabilités de type SH basées sur la vraisemblance rapide. Voir Données supplémentaires pour des méthodes détaillées. La souche du patient ZIKV Haïti est regroupée au sein d’un clade bien supporté. du Brésil, du Venezuela et de la seule autre souche haïtienne du génome complet disponible, isolée dans la même région d’Haïti, en séquences jaunes surlignées, Figure A Figure vue en grandDétaillée DiapositivePhylogénétique et phylogéographie du virus Zika ZIKV souches A, Arbre à vraisemblance maximale de ZIKV complet séquences du génome Les branches sont mises à l’échelle dans les substitutions de nucléotides par site en fonction de la barre au bas de l’arbre * Indi cates bootstrap support & gt;% ou probabilité significative de type Shimodaira-Hasegawa P & lt; ** Indique un soutien significatif dans les deux tests La séquence Haïti ZIKV Haïti // est en gras Surligné en jaune est le clade contenant ZIKV Haïti //, la seule autre souche haïtienne entièrement séquencée de KU, une souche brésilienne de KU, et une variété vénézuélienne à partir de KU B, Arbre de crédibilité maximum du clade avec reconstruction phylogéographique bayésienne de la région du gène ZIKV NS Les branches sont échelonnées dans le temps et colorées selon la légende à gauche où chaque couleur représente l’emplacement géographique des branches de la séquence échantillonnée, ainsi que les branches internes de la lignée ancestrale inférées par la phylogéographie bayésienne L’horloge moléculaire a été étalonnée en utilisant les temps d’échantillonnage connus des souches ZIKV et en appliquant une horloge moléculaire relâchée avec un graphique démographique de Bayesian skyline auparavant voir Méthodes supplémentaires probabilités postérieures & gt; sont indiqués le long des branches La séquence haïtienne est en gras Les événements migratoires proposés impliquant les souches haïtiennes sont indiqués par des flèches: La flèche rouge indique le flux de gènes viraux de l’île de Pâques à Haïti; la flèche verte indique le flux de gènes viraux d’Haïti vers l’île de Pâques, et la flèche orange indique le flux de gènes viraux d’Haïti vers le VenezuelaFigure View largeTélécharger diapositiveAnalyse phylogénétique et phylogéographique des souches ZIKV du virus Zika A, arbre à maximum de vraisemblance des séquences complètes du génome du ZIKV. à l’échelle dans les substitutions de nucléotides par site en fonction de la barre au bas de l’arbre * Indique un soutien bootstrap & gt;% ou une probabilité significative de type Shimodaira-Hasegawa P & lt; ** Indique un soutien significatif dans les deux tests La séquence Haïti ZIKV Haïti // est en gras Surligné en jaune est le clade contenant ZIKV Haïti //, la seule autre souche haïtienne entièrement séquencée de KU, une souche brésilienne de KU, et une variété vénézuélienne à partir de KU B, Arbre de crédibilité maximum du clade avec reconstruction phylogéographique bayésienne de la région du gène ZIKV NS Les branches sont échelonnées dans le temps et colorées selon la légende à gauche où chaque couleur représente l’emplacement géographique des branches de l’extrémité échantillonnée, ainsi que les branches internes de la lignée ancestrale inférées par la phylogéographie bayésienne L’horloge moléculaire a été étalonnée en utilisant les temps d’échantillonnage connus des souches ZIKV et en appliquant une horloge moléculaire relâchée avec un graphique démographique de Bayesian skyline auparavant voir Méthodes supplémentaires probabilités postérieures & gt; sont indiqués le long des branches La séquence haïtienne est en gras Les événements migratoires proposés impliquant les souches haïtiennes sont indiqués par des flèches: La flèche rouge indique le flux de gènes viraux de l’île de Pâques à Haïti; la flèche verte indique le flux de gènes viraux d’Haïti vers l’île de Pâques, et la flèche orange indique le flux de gènes viraux d’Haïti au Venezuela

Une analyse phylogéographique détaillée a été réalisée sur l’alignement NS, qui représente actuellement le plus grand ensemble de données de souches ZIKV, avec le cadre bayésien implémenté dans la version BEAST L’analyse a permis de reconstruire les localisations ancestrales des lignées ZIKV actuellement circulant en Amérique du Sud Conformément à nos résultats précédents , cette analyse a montré que des souches sud-américaines émergeaient de lignées asiatiques circulant en Thaïlande et en Polynésie française, initialement disséminées sur l’île de Pâques, et introduites en Haïti par la suite. Des lignées haïtiennes ancestrales ont également été à l’origine de souches récemment échantillonnées à l’île de Pâques et aux flèches orange et verte en mars, quelques jours après que ses premiers échantillons de symptômes, d’urine et de salive aient été testés et négatifs pour les ARNv du ZIKV et du DENV. par RT-PCR et isolement du virus

DISCUSSION

La co-infection par le ZIKV et le DENV a été décrite, comme on peut s’y attendre étant donné que le moustique Aedes peut servir de vecteur aux deux On a rapporté qu’environ% des infections à ZIKV sont asymptomatiques , tout comme un pourcentage comparable d’infections à DENV En cas d’infection symptomatique par le ZIKV ou le DENV, les manifestations cliniques sont similaires, bien que les personnes atteintes du virus Zika présentent habituellement des symptômes bénins Il est à noter que le gonflement des membres inférieurs a été décrit comme unique Cependant, notre patient avec une double infection par le virus DENV / ZIKV présentait des manifestations à l’extrémité la plus grave du spectre clinique que ce qui a été décrit pour l’infection par le ZIKV seul, y compris les arthralgies sévères et le gonflement des articulations. cela peut simplement représenter une variation individuelle, il est reconnu que les anticorps DENV peuvent améliorer l’infection par le virus ZIKV, au moins dans un contexte in vitro ; L’impact de la co-infection par le ZIKV et le DENV sur la sévérité de la maladie chez les patients reste à déterminerRT-PCR pour le DENV et le ZIKV permet la détection d’une double infection en cas d’utilisation d’amorces discriminatoires. une semaine après l’apparition des symptômes, le virus peut être retrouvé plus longtemps dans l’urine et la salive Néanmoins, de faibles taux de virémie peuvent affecter les résultats de la RT-PCR, peut-être en raison du détecter les deux virus à partir des surnageants de culture de cellules infectées en utilisant des amorces discriminatoires suivies par un séquençage pour vérifier l’unicité des virus nous a permis d’établir une double infection chez ce patientLes conclusions phylogénétiques sont compatibles avec la diversification du virus en Haïti. séquences de génome montre que ZIKV Haïti // se regroupe dans la lignée Asiatique / Sud-américaine, mais ne partage pas un L’analyse en profondeur utilisant des séquences de gènes NS basées sur la phylogéographie bayésienne suggère au moins des événements distincts de migration de flux de gènes viraux impliquant des souches haïtiennes: le plus ancien de l’île de Pâques à Haïti, et les indépendants d’Haïti retour à l’île de Pâques et au Venezuela, respectivement Figure B Bien que ces événements soient soutenus par des probabilités postérieures relativement faibles dans l’arbre phylogéographique, une tendance similaire est fortement soutenue dans l’arbre du maximum de vraisemblance, mais limitée par le manque de séquences génomiques disponibles. Dans l’ensemble, ces analyses phylogénétiques soulignent la diversification et la propagation du ZIKV en Amérique et en Haïti en particulier. En conclusion, les modèles épidémiologiques moléculaires observés soulèvent la possibilité que l’évolution continue et la dissémination subséquente des différentes lignées virales en Amérique du Sud pourrait éventuellement conduire à l’émergence de roman v ARIANTS avec des caractéristiques génomiques distinctes par rapport aux souches parentes, qui pourraient inclure des changements dans la virulence, la transmissibilité et la pathogenèse

Données supplémentaires

Les documents supplémentaires sont disponibles à l’adresse http: // academicoupcom / cid Composé de données fournies par l’auteur au profit du lecteur, les documents publiés ne sont pas copiés et relèvent de la seule responsabilité de l’auteur, les questions ou commentaires doivent donc être adressés à l’auteur

Remarques

Soutien financier Ce travail a été soutenu par un financement institutionnel mis à disposition par l’Emerging Pathogens Institute de l’Université de Floride Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels d’intérêts que les éditeurs jugent pertinents au contenu du manuscrit ont été divulgués